Laborator Microbiologie Clinică

Laboratorul de Microbiologie Clinică face parte din rețeaua națională de supraveghere a rezistenței la antibiotice. De asemenea, este membru al European Antimicrobial Surveillance System (EARS-Net) și participă anual la programele de control extern al calității organizate de EARSS.

Acreditare și certificări

Laboratorul este acreditat din anul 2005, în 2014 conform Standardului SR EN 15189:2013, iar în anul 2024 conform Standardului SR EN 15189:2023 – „Laboratoare medicale. Cerințe pentru calitate și competență”, garantând respectarea celor mai înalte standarde de performanță și precizie în diagnostic.

Proveniența și tipologia pacienților

Laboratorul analizează prelevate patologice provenite de la:

  • pacienți internați în Spitalul Clinic de Boli Infecțioase și Tropicale “Dr. Victor Babeș”, cu o gamă variată de patologii infecțioase: infecții sistemice, meningo-encefalite, infecții de tract urinar, infecții de tract respirator superior/inferior, secreții plăgi/colecții purulente etc.;
  • pacienți cu patologie infecțioasă grefată pe diverse cauze de imunodepresie: HIV/SIDA, tuberculoză, hepatite virale B și C, hemomalignități, diverse forme de cancer, pacienți cu transplant de organe;
  • pacienți transferați de la alte spitale, cu patologie infecțioasă diversă, pentru diagnostic și pentru  consolidarea tratamentului antibiotic;
  • pacienți cu boli tropicale: holeră, febră tifoidă, diareea “calatorului” etc.;
  • pacienți cu tuberculoză pulmonară și extra-pulmonară incluși în Programul Național de Supraveghere și Control a Tuberculozei.

În Laboratorul de Microbiologie se efectuează testele de screening al portajului de bacterii MDR, pentru pacienții care se internează în spital sau sunt admiși în Terapie Intensivă și care îndeplinesc criteriile epidemiologice de screening.

Laboratorul de Microbiologie este preocupat de analiza în dinamică a antibiorezisțentei speciilor bacteriene cel mai frecvent izolate din infecțiile comunitare și infecțiile nosocomiale, pentru cunoașterea circulației fenotipurilor de rezistență și utilizarea informațiilor în administrarea empirică a antibioticelor.

În plus, analizele de microbiologie sunt disponibile și contra cost, ca servicii medicale cu plată.

Activități de diagnostic și cercetare

Pe lângă activitatea de diagnostic clinic, laboratorul participă la:

  • Programe Naționale de supraveghere și monitorizare, incluzând:Tuberculoza, infecția HIV/SIDA, infecții asociate asistenței medicale/infecții nosocomiale, boala diareică, rezistența la antibiotice.
  • Proiecte de cercetare naționale și internaționale, precum:
  • Capacities – Research Infrastructures / FP7 – „European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents” (2010).
  • Studiul observațional prospectiv EURECA (start 2016), din domeniul COMBACTECARE, privind rezistenta la carbapenemaze în regiunea de est a Europei.
  • Studiul ANTICIPATE (perioada 2016-2017), din secțiunea COMBACTE-NET a fost un studiu observațional asupra pacienților cu vârsta de peste 30 ani, având ca obiectiv monitorizarea prevalentei infecțiilor cu Clostridioides difficile.
  • Studiul COMBACTE CDI (2017) a fost o colaborare în cadrul a 3 pachete de lucru ale proiectului (WP2, WP3, WP4), pentru o mai bună înțelegere a epidemiologiei și practicilor clinice la nivel european, în ceea ce privește infecția cu Clostridioides d
  • Proiectul National AntarcticPharm (UEFISCDI 140/ PED/ 2017-2018) – Bacteriile antarctice contra patogenilor umani: în căutare de noi compuși antibacterieni.
  • Studiul REVISIT, sub forma unui studiu clinic de faza III, în secțiunea COMBACTE- CARE, obiectivul studiului fiind stabilirea siguranței și eficacității tratamentului cu AztreonamAvibactam în anumite infecții cu bacterii Gram-negative rezistente. România este reprezentâtă în acest studiu ca site.

Echipa medicală

Laboratorul este deservit de un personal specializat, format din:

  • 3 medici primari (dintre care 1 cadru universitar, doctor în științe medicale), în specialitatea Medicină de laborator;
  • 1 medic specialist în specialitatea Medicină de laborator;
  • 1 medic specialist în specialitatea Microbiologie medicală;
  • 16 asistenți medicali de laborator;
  • 1 registrator medical;
  • 2 laboranți.

Laborator de Microbiologie Clinică – Diagnostic Clasic și Automat

Laboratorul este echipat cu tehnologie de ultimă generație pentru izolarea, identificarea și testarea susceptibilității microbiene, asigurând un diagnostic precis și rapid.

Echipamente principale

  • Hote de biosiguranță clasa II – asigură un mediu de lucru sigur pentru manipularea microorganismelor patogene.
  • Sistem automat de distribuire a mediilor de cultură solide – asigură o distribuție sterilă și automată, cu precizie ridicată, optimizând procesul de însămânțare și reducând riscul de contaminare.
  • Centrifuge – capacitate maximă de 5000 rot/min pentru separarea componentelor biologice.
  • Autoclave și etuve – sterilizare eficientă a materialelor de laborator și a deșeurilor infecțioase.
  • Incubatoare și termostate cu temperatura reglabilă – menținerea constantă a temperaturii pentru incubarea culturilor microbiene, la diverse temperaturi.
  • Microscoape optice – utilizate pentru examinarea preparatelor colorate (Gram, Giemsa, Ziehl-Neelsen) și preparatelor proaspete.
  • Balanță analitică BCA 200S  – pentru cântăriri de precizie.
  • Plită pentru uscarea frotiurilor.
  • Frigidere și congelatoare (-20°C / -80°C) – pentru stocarea probelor biologice și reactivilor.
  • Sistem de producere a apei distilate – esențial pentru pregătirea mediilor de cultură și reactivilor.
  • BacT/ALERT 3D – sistem automat pentru incubarea flacoanelor de hemocultură ți a flacoanelor cu mediu lichid pentru izolarea Mycobacterium tuberculosis din diverse prelevate clinice.
  • Analizor MALDI-TOF (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight) – tehnologie de spectrometrie de masă utilizată pentru identificarea rapidă a bacteriilor și fungilor.
  • VITEK2C – sistem automat de identificare bacteriană, fungică și efectuarea antibiogramelor/ antifungigramelor cantitative.
  • Borealys G, Borealys Z – aparate automate pentru colorare frotiuri Gram și Ziehl-Neelsen.
  • BACT–R Plus/ SOBIODA – sistem care creează atmosfera de anaerobioză și microaerofilie.
  • Sistem MICRONAUT și cititor automat TECAN/ Sunrise – metodă bazată pe microdiluții în bulion, conform ghidului EUCAST, pentru testarea susceptibilității la antimicotice și antibiotice.

Laborator de Diagnostic Molecular

Acest laborator dispune de echipamente avansate pentru detectarea agenților patogeni și a genelor de rezistență la antibiotic prin metode moleculare, oferind un diagnostic rapid și precis.

Echipamente principale

  • Hote de biosiguranță clasa II – cu flux laminar, UV și gaz, utilizate pentru prelucrarea probelor, extracția acizilor nucleici și prepararea reactivilor.
  • Vortex-mixer – pentru omogenizarea probelor.
  • Thermoblocuri (65°C, 37°C) – pentru incubarea enzimatică a probelor.
  • Centrifuge pentru tuburi Eppendorf – capacitate maximă 20.000 x g, cu și fără răcire.
  • Spectrofotometru – pentru analiza concentrației și purității acizilor nucleici.
  • Mini-centrifuge (max 2000 x g) – pentru procesarea rapidă a probelor.
  • Mini LabRoller Rotator – pentru amestecarea controlată a probelor.
  • Răcitoare portabile (0°C și -15°C) – pentru transportul și păstrarea probelor sensibile.
  • Congelator (-80°C) – pentru stocarea pe termen lung a probelor și reactivilor.
  • Pipete monocanal și multicanal autoclavabile – pentru manipularea precisă a lichidelor.
  • Real-Time PCR GeneXpert – multiplex PCR, utilizat pentru diagnosticul molecular al infecțiilor virale respiratorii, al tuberculozei, detecția rezistenței la antibiotic și detecția toxinelor produse de Clostridioides difficile (Toxina B, toxina binară și ribotipul 027).
  • Real-Time PCR multiplex QIAstat-Dx – pentru diagnostic sindromic (meningo-encefalite, respirator, digestiv), capabil să detecteze simultan între 20-30 agenți patogeni într-o singură probă.
  • Real-Time PCR multiplex BioFire FilmArray – pentru diagnostic sindromic, sistem de diagnostic molecular pentru identificarea rapidă a bacteriilor, virusurilor și fungilor și genelor de antibiorezistență, într-o singură probă.
  • Molecular Mouse (Alifax) – identificare rapidă a microorganismelor și analiza rezistenței la antibiotice din flacoanele pozitivate de hemocultură.
  • T2BioSystems – identifică diverse paneluri multiplex direct din sânge integral, specii bacteriene din grupul ESKAPE și specii din genul Candida.
  • MICPCR – sistem automat de detecție și cuantificare a acizilor nucleici totali din diverse prelevate și culturi izolate.
  • Real-Time PCR (CFX96) – permite detecția și cuantificarea acizilor nucleici totali direct din prelevate clinice sau culturi.
  • GenoXtract – sistem compact automatizat pentru extracția ADN/ARN din diverse probe biologice.

Laboratorul de Bacteriologie-Micologie

Laboratorul oferă servicii de diagnostic avansat, combinând metode clasice și automate pentru detectarea, identificarea și testarea susceptibilității microorganismelor, asigurând precizie și rapiditate în diagnostic, esențial pentru managementul eficient al infecțiilor.

Servicii oferite

 Diagnostic bacteriologic și micologic – metode clasice și automate:

  • Detecția agenților etiologici ai patologiilor infecțioase prin sisteme clasice și automate (BacT/ALERT 3D), incluzând:
    • bacterii patogene și condiționat patogene;
    • Mycobacterium tuberculosis și Mycobacterium nonTB;
    • levuri și fungi filamentoși.
  • Se analizează o gamă variată de probe clinice, inclusiv cele prelevate din situsuri anatomice sterile sau din infecții comunitare și infecții asociate asistenței medicale (IAAM).
  • Examinare macroscopică și microscopică, utilizând:
  • colorații specifice (Gram, Giemsa, Ziehl-Neelsen);

Identificare rapidă și precisă prin metode clasice și sisteme automate:

  • analiza proprietăților exoenzimatice și antigenice;
  • MALDI-TOF Bruker – spectrometrie de masă pentru identificarea rapidă a bacteriilor și fungilor;
  • VITEK 2 Compact – analiză automatizată a caracteristicilor biochimice pentru identificare microbiologică detaliată.

 Testarea susceptibilității la antibiotice și antifungice:

 

  • Metode standardizate, conform ghidului EUCAST:
    • Test difuzimetric (disc-diffusion Kirby-Bauer) – metodă clasică pentru determinarea sensibilității bacteriene.
    • Metoda microdiluțiilor în bulion (Micronaut) – analiză automatizată a concentrației minime inhibitorii (CMI) pentru antibiotice și antifungice.
  • Sisteme automate de identificare și testare a rezistenței la antibiotice, optimizând procesul de diagnostic (VITEK2C, MALDITOF Bruker).

Diagnostic bacteriologic și micologic prin tehnici moleculare:

 

Laboratorul combină tehnicile clasice și moleculare pentru un diagnostic microbiologic complet, oferind un timp de răspuns rapid și o acuratețe ridicată, esențiale pentru un tratament eficient și personalizat.

  1. Detecția și cuantificarea ADN/ARN prin Real-Time PCR:

 

  • Real-Time PCR (CFX96) – permite detecția și cuantificarea ADN-ului bacterian și micologic, direct din prelevate clinice sau culturi.
  • Real-Time PCR multiplex (QIAstat-Dx, BioFire FilmArray) – identificare simultană a multiple bacterii, virusuri și paraziți din probe clinice (materii fecale, exudat nazo-faringian, spută, aspirate traheale și bronhice).
  1. Diagnosticul molecular al infecțiilor bacteriene și micologice
  • Detecția ADN Mycobacterium tuberculosis și screening-ul rezistenței la Rifampicină (GeneXpert).
  • Identificarea mecanismelor de rezistență bacteriană:
    • Detecția carbapenemazelor la tulpinile bacteriene (GeneXpert).
    • Molecular Mouse (Alifax) – identificarea rapidă a microorganismelor din flacoane pozitivate de hemocultură.
  • Detecția toxinelor produse de Clostridioides difficile:
    • Toxina B, toxina binară și ribotipul 027 în materii fecale (GeneXpert).